I principali bacini idrici della Pennsylvania sono il lago Erie, il fiume Delaware, il lago Conneaut, il lago Wallenpaupack, il fiume Susquehanna, il fiume Allegheny, il fiume Monongahela e il fiume Ohio. I fiumi Beaver, Clarion e Youghiogheny sono importanti tributari del sistema fluviale Allegheny-Monongahela-Ohio.
Lo stato della Pennsylvania ha circa 250 laghi naturali. La maggior parte di questi si trovano nelle regioni nord-orientali e nord-occidentali. La Pennsylvania ha giurisdizione di oltre 21 miglia quadrate del bacino idrico Pymatuning, situato al confine con lo stato dell'Ohio. Quasi il 46 percento dell'acqua dai monti Appalachi viene prosciugata dal fiume Susquehanna e dai suoi affluenti. Il confine orientale della Pennsylvania è formato dal fiume Delaware mentre la parte occidentale è prosciugata dai fiumi Allegheny e Monongahela.
