La pulizia profonda arresta la progressione della malattia parodontale, previene il deterioramento dell'osso e del tessuto che sostiene i denti e incoraggia la ricrescita delle gengive. Una pulizia profonda non è la stessa di una pulizia dentale di routine, ed è utile solo per i pazienti con malattie gengivali o placca che sono stati rilevati sotto la linea gengivale.
I batteri e la placca e il tartaro che si formano sui denti che non vengono rimossi attraverso una regolare pulizia dentale si fanno strada sotto la linea delle gengive, causando un'infiammazione che fa allontanare le gengive dai denti, creando tasche. Queste tasche intrappolano cibo e batteri, aggravando il problema mentre l'infezione e l'infiammazione si dirigono verso la radice del dente e l'osso che sostiene il dente.
Durante la pulizia profonda, la piallatura e il ridimensionamento con uno strumento di raschiatura o uno strumento a ultrasuoni rimuovono batteri, placca e tartaro dalle gengive e dal dente fino alle radici. Questo lascia una superficie liscia sul dente affinché le gengive si riattaccino. Gli antibiotici sono prescritti per l'uso prima e dopo la procedura, o un pezzo di fibra antibiotica può essere lasciato tra le gengive e i denti per trattare l'infezione esistente e prevenire l'infezione da eventuali batteri che entrano nel flusso sanguigno durante la pulizia profonda.