Ci sono tre modi per distinguere tra canarini maschi e femmine: ispezione genitale, aspetto del colore e canto iniziale. L'allevatore Sebastian Vallelunga ritiene che ispezionare un canarino sessualmente maturo sia un metodo praticamente infallibile, il maschio ha uno pseudo-pene che sporge dalla sua bocca, mentre una femmina ha una cupola rotonda che sporge sopra la bocca. Le femmine pronte a riprodursi hanno un ventre uniforme a forma di siluro che si restringe ad un'estremità.
L'indicazione più ovvia e affidabile del genere è se il canarino depone o meno un uovo. Alcuni allevatori preferiscono separare i sessi in anticipo per promuovere uno sviluppo migliore della canzone tra i maschi, anche prima che i pulcini si sfidino. Esaminare la canzone iniziale e analizzare in base al colore sono strumenti utili.
Il primo canto del canarino, noto come sottotitola, è un trillo sognante durante il quale la gola del maschio si gonfia, riflettendo il successivo comportamento adulto. Durante la prossima fase di apprendimento delle canzoni, la canzone di plastica, il maschio inizia a integrare passaggi e frasi di adulti nella sua canzone, rendendolo un indicatore più affidabile del genere.
L'aspetto del colore è un metodo meno coerente con variazioni tra le specie che si applicano meglio ai canarini che sono strettamente correlati o appartengono allo stesso ceppo. In generale, Vallelunga crede che il canarino più chiaro sia femminile.