Le principali risorse naturali del Kenya includono la pesca, l'acqua, le foreste, le zone umide, la biodiversità e una varietà di minerali. Questi minerali includono calcare, pietre preziose, sale, zinco, gesso, diatomite, calcare e altri.
Le risorse naturali del Kenya affronta minacce da attività socio-economiche come agricoltura, commercio, turismo e insediamenti umani. Il paese affronta anche l'inquinamento idrico da rifiuti generati dall'uomo, bracconaggio e deforestazione. L'uso di fertilizzanti chimici e pesticidi si traduce anche in una scarsa qualità dell'acqua. A causa di leggi inadeguate riguardanti l'uso della terra e delle risorse naturali, il Kenya ha sperimentato risorse e gestione delle terre scarse, nonché dispute sulla terra che hanno portato a ingiustizie e povertà diffusa.
La geografia del Kenya è composta da basse pianure che si ergono in altipiani che lasciano il posto alla Great Rift Valley. I due principali fiumi del Kenya sono la Tana e la Galana, e un altopiano fertile si trova nella parte occidentale del paese. Poco più dell'1% del territorio è occupato da colture permanenti, ma oltre il 9% è coltivabile.
Il Kenya affronta inondazioni durante le stagioni delle piogge e gravi siccità in altri periodi dell'anno. C'è anche qualche attività vulcanica, e la maggior parte della geologia del paese è dominata dalla tettonica di rift lungo la Great Rift Valley.
