Alcune cellule, incluse euglenas e varie specie batteriche, usano proiezioni simili a una coda chiamate flagelli per spostarsi su una superficie. Altre cellule, inclusa la paramecia, usano numerose proiezioni simili a capelli chiamate ciglia per la locomozione.
Le celle possono avere uno o più flagelli. A volte tutti i flagelli si trovano su un lato dell'organismo e altre volte sono divisi tra due o più lati. La maggior parte delle specie che hanno flagelli usano un flagello per tirarsi su, piuttosto che spingere attraverso una superficie. Tendono a muoversi in un modello a cavatappi. I flagelli sono ancorati alle cellule da strutture note come axoneme. Poiché il flagello è una parte vivente della cellula, ha bisogno di sostanze nutritive per sopravvivere. Questi materiali sono passati attraverso l'assonema e nel citosplasma all'interno del flagello.
Le ciglia sono piccole proiezioni che generalmente coprono l'intera superficie di una cella. Una singola cella può avere migliaia di ciglia. Si muovono in un movimento di voga avanti e indietro per spingere la cella su una superficie. Come i flagelli, le cilia sono per lo più costituite da proteine. Alcune specie usano anche le loro ciglia per scopi diversi dalla locomozione. Per esempio, le ciglia possono muoversi in modo tale da spingere il cibo in un solco orale o per spingere particelle offensive lontano dalla superficie della cellula.