Il numero di ossa varia da una specie di balena all'altra e dipende, in parte, dalla lunghezza della spina dorsale della balena. I capodogli contengono 164 ossa, mentre la balena blu, la più grande animale sulla terra, ha 356 ossa.
Lo scheletro di una balena contiene un teschio, una colonna vertebrale e una gabbia toracica, oltre alle ossa che formano le sue pinne. Lo scheletro dentro la pinna di una balena sembra una versione di una mano umana; contenenti una spalla, l'osso del braccio, le ossa del braccio inferiore, le ossa del polso e le falangi o le ossa del tipo a dita. Le balene contengono anche molte piccole ossa che fluttuano verso la loro coda. Gli scienziati credono che queste siano vestigia residue di quelle che una volta erano le zampe posteriori.
