Le macroalghe sono grandi alghe fotosintetiche coltivate in acquari marini. Servono come fonte di cibo per gli animali erbivori, filtrano le impurità dal serbatoio e aggiungono un valore estetico all'acquario.
Alcuni tipi di macroalghe presenti negli acquari marini includono halimeda, caulerpa sp. e i capelli della fanciulla. Ogni tipo di macroalghe ha esigenze crescenti specifiche, ma in generale tutte le macroalghe vanno bene in buone condizioni di acqua e in piena luce. I filtri alle alghe sono considerati approcci naturali per il filtraggio del serbatoio dell'acquario. I filtri consistono di uno o più tipi di alghe coltivati in un pozzetto o in un refugium sotto l'acquario principale o in un refugium laterale.