Molti botanici utilizzano strumenti come lenti di ingrandimento, fotocamere, dispositivi GPS, guide di campo e computer. Inoltre, un semplice taccuino e una matita sono strumenti di valore inestimabile che consentono ai biologi di campo di registrare le loro osservazioni. I botanici usano una varietà di strumenti diversi, a seconda della loro specialità e del compito specifico che stanno cercando di realizzare.
Alcuni botanici lavorano in laboratori con strumenti e attrezzature altamente avanzati. Ad esempio, i botanici che stanno cercando di indagare il DNA o la struttura microscopica di una pianta possono richiedere microscopi e altre apparecchiature di laboratorio ad alta tecnologia. Altri botanici lavorano nelle serre, studiando le abitudini di crescita e le esigenze nutrizionali delle piante. Tali scienziati devono usare igrometri, kit per il test del suolo e altri dispositivi di misurazione. I botanici orientati accademicamente, in particolare quelli che si concentrano sullo studio della tassonomia o sistematica, passano la maggior parte del loro tempo usando i computer e consultando libri per completare il loro lavoro.
Potatori, cesoie e troncarami sono usati dai botanici con una varietà di specialità, specialmente tra coloro che lavorano nel campo. Alcuni botanici usano uno strumento chiamato hori-hori per scavare le radici di piccole piante erbacee. Contenitori e sacchi di raccolta sono utili per il trasporto dei campioni in laboratorio per analisi più dettagliate. Le presse per piante sono anche strumenti utili che consentono ai botanici di conservare le foglie per futuri studi.