Gli uomini possiedono genitali esterni (il pene, lo scroto e i testicoli) per la produzione e la consegna dello sperma e le donne possiedono genitali interni (la vagina, l'utero e le ovaie) per la produzione di uova e lo sviluppo di embrioni umani. La maggior parte delle differenze fisiologiche tra uomini e donne si verificano a causa delle differenze nei sistemi endocrini durante i periodi critici dello sviluppo, come la crescita fetale e la pubertà.
Le funzioni dei sistemi endocrini negli uomini e nelle donne portano ad altre differenze fisiologiche nel corso della vita. Ad esempio, gli uomini producono un tipo di follicolo pilifero più visibile e visibile, chiamato peli terminali sul petto, sull'addome, sul viso e sulla schiena. Le donne, tuttavia, producono un follicolo pilifero più fine chiamato peli di vello in un minor numero di parti del corpo. La produzione di ormoni nel sistema endocrino è anche parzialmente responsabile dello sviluppo e delle differenze di calvizie negli uomini e nelle donne.
Grandi differenze sono presenti anche nei sistemi scheletrici e muscolari negli uomini e nelle donne. In genere, gli uomini possiedono tendini più densi, più forti, legamenti e ossa rispetto alle donne, e gli uomini hanno generalmente più massa muscolare. Ciò porta a differenze nella forza fisica e nei processi metabolici di dispendio calorico e conservazione. In confronto, le donne in genere possiedono un sistema scheletrico che è meno robusto e più liscio nella struttura di quello che si trova nei maschi.