Newton morì nel suo sonno a Londra, in Inghilterra, il 31 marzo 1727, all'età di 85 anni. Il giorno precedente, dopo aver sofferto un forte dolore all'addome, Newton svenne e non riacquistò mai più coscienza.
Verso la fine della sua vita, i problemi di digestione hanno costretto Newton a cambiare drasticamente la sua dieta e mobilità. Padre fondatore della fisica moderna, Newton non si sposò mai e aveva pochi amici, lasciando molti a essere preoccupati per la sua stabilità mentale ed emotiva.
Isaac Newton fu sepolto nell'Abbazia di Westminster. Dopo la sua morte, i suoi capelli sono risultati positivi al mercurio, molto probabilmente dalle sue attività alchemiche. L'avvelenamento da mercurio è pensato per essere una potenziale causa per la sua eccentricità in seguito nella vita.
