I pellegrini della colonia della baia di Plymouth erano Calvinisti e Separatisti puritani, mentre i Puritani della colonia del Massachusetts Bay erano determinati a riformare la Chiesa anglicana dall'interno. Mentre entrambi erano protestanti e puritani, avevano obiettivi diversi e credenze.
La maggior parte dei puritani desiderava purificare le pratiche della chiesa anglicana, preferendo riformarla dall'interno per rimuovere tutti i segni del culto cattolico. Molti di questi Puritani iniziarono la colonia del Massachusetts Bay per costruire la loro città su una collina, una chiesa che altri puritani potevano vedere come un modello. Tuttavia, i pellegrini avevano stabilito alla fine del 16 ° secolo che la Chiesa anglicana era al di là delle riforme. Pertanto, si erano separati interamente dalla Chiesa, molti di loro si trasferirono in Olanda prima di emigrare nelle colonie americane.
Mentre queste differenze sembrano minori, è stato più facile per i Puritani del Massachusetts ottenere finanziamenti e l'approvazione e la protezione del trono britannico di quanto non fosse per i Pellegrini. Inoltre, i Puritani del Massachusetts erano in generale un gruppo più istruito e più ricco dei Pellegrini, che erano per lo più artigiani e agricoltori. Ciò ha portato, nel tempo, a una maggiore prosperità e a una crescita molto più rapida per l'area di Boston-Salem. Nel 1691, la piccolissima Colonia di Plymouth si fuse con la colonia del Massachusetts Bay per formare la provincia del Massachusetts Bay.