L'eutrofizzazione di un ecosistema acquatico può essere rallentata o invertita rallentando l'aggiunta di sostanze nutritive al sistema. Le fonti di nutrienti in eccesso possono essere fisicamente bloccate dall'entrare nell'ecosistema interessato. In alternativa, queste fonti possono essere trattate per rimuovere i nutrienti in un punto a monte dell'ecosistema interessato.
I corpi idrici diventano eutrofici a causa di un aumento delle sostanze nutritive disponibili, più comunemente fosforo e azoto. Alcuni flussi di rifiuti ad alto contenuto di nutrienti entrano accidentalmente in laghi e fiumi; altri vengono deliberatamente scaricati come mezzo per smaltire materiali indesiderati. Le comuni fonti di nutrienti sono il letame agricolo e il deflusso di fertilizzanti e gli effluenti delle acque reflue municipali.
Le pratiche agricole, come la ridotta lavorazione del terreno, la ridotta applicazione di fertilizzanti e la copertura del raccolto, aiutano a ridurre al minimo la quantità di ruscellamento del fertilizzante che si verifica. Recinzioni e zone tampone vegetative impediscono inoltre al suolo e ai fertilizzanti idrosolubili di lasciare campi agricoli e di entrare nei laghi e nei torrenti. Fonti di concime agricole che sono contenute, trattate e gestite correttamente e che non fluiscono direttamente nei laghi e nei fiumi contribuiscono ulteriormente a prevenire l'eutrofizzazione. È anche importante impedire che bovini e altri animali pascolino vicino o camminino attraverso corsi d'acqua e fiumi. Un proprietario di abitazione privato può ridurre la quantità di fertilizzante che utilizza e utilizzare prodotti per la cura del prato a basso contenuto di fosfato.
