Esempi di funghi saprofiti possono includere Rhizobium e Rhizopus. Gli organismi saprofiti sono caratterizzati dalla loro capacità di sostenersi nutrendosi di materiali organici morti e in decomposizione.
I funghi, come il Rhizobium, aiutano a sostenere la vita delle piante fornendo ammoniaca per la vegetazione circostante utilizzando l'azoto assorbito dall'aria. Rhizopus è un fungo che si trova comunemente sul pane e che lo fa scomporre in nutrienti più semplici per essere utilizzato da altri organismi. I funghi saprofiti sono essenziali per l'ecosistema a causa della loro funzione di prevenire l'accumulo di materia organica morta e il riciclaggio di sostanze nutritive. Usano gli enzimi per abbattere i corpi degli animali morti o delle sostanze vegetali in sostanze nutritive, come la lignina, che fungono da fonte di carbonio per l'ecosistema.
