La ventilazione umana viene effettuata anche dall'apparato respiratorio. Viene usato per respirare ossigeno per i processi naturali e quindi espellere i rifiuti gassosi, come umidità, anidride carbonica e tracce di altri gas. Questo sistema dà ossigeno direttamente al sangue; il sangue distribuisce l'ossigeno ovunque.
L'apparato respiratorio umano è costituito da un tubo che porta dal naso e dalla bocca fino a due polmoni. I polmoni hanno milioni di cellule specializzate chiamate alveoli. Queste cellule filtrano l'ossigeno dal resto del gas inspirato per fornire direttamente al sangue. Questo è possibile a causa dei minuscoli vasi sanguigni chiamati capillari che circondano gli alveoli.
La respirazione è controllata dall'espansione e dalla contrazione del diaframma. Questo muscolo a forma di cupola si trova sotto i polmoni e comprime e espande i polmoni per fare in modo che il corpo esegua il riflesso subconscio della respirazione. Il diaframma fa questo circa 12 a 20 volte al minuto, cambiando in base a ciò che un individuo sta facendo.
Le persone in stato di panico possono essere iperventilate o respirare molto più velocemente del normale, nel tentativo di introdurre più ossigeno nel sangue in caso di emergenza. Questo riflesso biologico è uno dei pochi che può essere controllato coscientemente. Chiunque sia iperventilato può calmarsi costringendo una respirazione più misurata.