L'organello che modifica e confeziona le proteine è l'apparato di Golgi. Questo organello comprende numerose sacche appiattite chiamate cisterne. L'apparato di Golgi, chiamato anche corpo di Golgi o complesso di Golgi, ha due lati o facce, la faccia cis e la faccia trans, come descritto in "La cellula: un approccio molecolare".
L'apparato di Golgi recupera le proteine trasportate in vescicole prodotte nel reticolo endoplasmatico. L'organello modifica quindi queste proteine tagliando alcune sezioni o aggiungendo le molecole necessarie. Una vescicola si forma intorno alla proteina, si stacca dall'apparato di Golgi e viaggia fino a dove è necessaria la proteina. La faccia cis dell'apparato di Golgi si trova vicino al reticolo endoplasmatico per ricevere i suoi prodotti. La faccia trans dell'organello è posizionata vicino alla membrana plasmatica, pronta a trasportare la proteina finita fuori dalla cellula.
