L'Indonesia è un arcipelago situato nell'emisfero orientale tra il Sudest asiatico e l'Australia. Il paese confina con Papua Nuova Guinea, Timor Est e Malesia. Altre masse limitrofe comprendono Singapore, i territori indiani di Andaman e le isole Nicobar e le Filippine.
Oltre 17.500 isole comprendono la nazione dell'Indonesia, la più grande delle quali è Sumatra, Giava, Borneo, Sulawesi e Papua. La nazione insulare è circondata da numerosi specchi d'acqua, tra cui i mari Java, Cina meridionale, Celebes, Flores, Banda, Bali, Timor e Arafura. Situato lungo l'Equatore, l'arcipelago fa anche parte della divisione tra Oceano Pacifico e Oceano Indiano.