I topi hanno ossa perché sono mammiferi, il che significa che sono vertebrati o animali con dorsali e sistemi scheletrici. I topi appartengono al più grande ordine di mammiferi, roditori o roditori, che include ratti, guinea maiali, cani della prateria, scoiattoli, castori e istrici.
I roditori sono caratterizzati da incisivi o denti affilati sulla mascella inferiore e superiore. Gli incisivi dei roditori crescono continuamente e la dentina sugli incisivi deve logorarsi per rosicchiare in modo che gli incisivi non crescano così a lungo da perforare il cranio. I topi sono membri di una gerarchia tassonomica di roditori chiamati roditori simili a topi, o miomorfi. Questo gruppo include topi domestici, ghiri, topi tascabili, topi saltatori, topi e gorroidi tascabili. I roditori simili a topi hanno strutture speciali della mascella e dei molari che danno loro potenti capacità di rosicchiamento. I roditori simili a topi sono ulteriormente suddivisi in gruppi tassonomici, di cui i topi fanno parte del gruppo chiamato muridae, che comprende anche ratti, lemming, arvicole, criceti e gerbilli.
I topi sono piccoli mammiferi con corpi snelli, musi affusolati, orecchie evidenti, artigli affilati e lunghe code. La più piccola specie, il topo pigmeo, pesa da un decimo a metà dell'oncia, mentre il più grande, il topo piatto indiano, pesa poco più della metà di un'oncia. La consistenza della pelliccia varia da corta e morbida a lunga e spinosa. I colori possono essere bianco, grigio, marrone, marrone rossastro, nero o una combinazione di questi.