Il pastore John Hagee divorziò dalla sua prima moglie, Martha, nel 1975. I due erano sposati da 15 anni e avevano due figli: un figlio di nome Christopher e una figlia di nome Tish.
Il pastore della Cornerstone Church sposò la sua seconda moglie, Diana, circa un anno dopo. Ha tre figli con la moglie Diana - Matthew, Christina e Sandy - e otto nipoti, a partire dal 2014. Matthew è diventato un pastore esecutivo nella chiesa di suo padre.
Oltre ad essere il pastore di una grande chiesa non confessionale, Hagee ha anche scritto diversi libri e viaggia spesso con la sua famiglia come parte di un gruppo di canto.
