Il sistema noto come il fiume Nilo scorre attraverso i paesi della Tanzania, Uganda, Ruanda, Burundi, Repubblica Democratica del Congo, Kenya, Etiopia, Eritrea, Sud Sudan, Sudan ed Egitto. I paesi attraverso i quali scorre il Nilo bianco sono il Sudan, il Sud Sudan, il Ruanda, la Tanzania, l'Uganda e la Repubblica Democratica del Congo. Il Nilo Azzurro attraversa l'Etiopia e il Sudan. La parte principale del Nilo scorre attraverso il Sudan e l'Egitto.
Il Nilo Bianco è la fonte primaria del fiume Nilo e inizia nei punti di incontro dei fiumi che scorrono dalla regione dei Grandi Laghi in Africa. La seconda fonte principale del fiume Nilo è il Nilo Azzurro, che inizia al Lago Tana in Etiopia. Quando questi fiumi si uniscono insieme, il fiume risultante è conosciuto semplicemente come il fiume Nilo. Altre fonti considerate parte del fiume Nilo comprendono il fiume Ruvyironza in Burundi e il fiume Nyabarongo in Ruanda. La parte del fiume che parte dal Lago Vittoria in Uganda è conosciuta come il Victoria Nile. In totale, il sistema fluviale che è considerato il fiume Nilo si estende per un totale di 4.258 miglia, con la foce del fiume che si trova lungo la costa egiziana del Mar Mediterraneo. Le principali città attraversate sono Juba nel Sudan del Sud, Il Cairo in Egitto, Khartum in Sudan e Jinja in Uganda.