Secondo SFGate, l'acqua dello stagno diventa marrone per una serie di motivi, ma le cause più comuni sono erosione del suolo, piante microscopiche e fauna selvatica. Elevate quantità di piante microscopiche come alghe e fitoplancton danno stagno innaffia un aspetto quasi simile al tè. L'erosione del suolo fa sì che le rive dello stagno si rompano e cadano nell'acqua, dandole un aspetto marrone.
SFGate afferma che la rapida crescita delle alghe, note come fioriture algali, sono causate da elevate quantità di rifiuti animali, azoto e fosforo nell'acqua dello stagno. Quando ciò accade, l'acqua dello stagno inizia a diventare verde. Tuttavia, quando le alghe iniziano a decomporsi, l'acqua inizia a diventare marrone. La rottura di qualsiasi tipo di materiale organico in uno stagno provoca acqua marrone. Un esempio di questo materiale organico è la caduta di foglie dagli alberi vicini.
C'è una varietà di modi per prevenire l'acqua di stagno marrone. Ad esempio, piantare la vegetazione attorno alle rive del laghetto crea una zona cuscinetto. Questo elimina il traffico pedonale vicino al bordo dello stagno, prevenendo l'erosione del suolo. È anche possibile tenere giù la popolazione di pesci in uno stagno rifornendola con pesci predatori come il persico trota.