Le cellule vegetali da un bulbo di cipolla mancano di cloroplasti perché questa parte della pianta cresce sottoterra, rendendola incapace di assorbire la luce necessaria per fotosintetizzare. La maggior parte delle radici sotterranee e le strutture a bulbo nelle piante non hanno cloroplasti per questo motivo.
Sebbene le cellule nella parte superiore del bulbo che sbirciano attraverso il terreno possano sviluppare cloroplasti, la funzione principale di queste cellule è quella di proteggere la pianta da agenti patogeni nocivi nel terreno e di immagazzinare energia. Queste funzioni sono rese possibili dalla parete cellulare, dalla membrana cellulare, dal citoplasma, dal nucleo e dal grande vuoto della cellula.
La microscopia ottica rende visibile il nucleo di una cellula di cipolla ai margini del citoplasma. Il vacuolo è visibile nel mezzo della cella. Questo vacuolo è trasparente nelle cellule delle cipolle bianche, rendendole invisibili alla microscopia ottica a meno che non siano macchiate. Le cellule di cipolle rosse sono naturalmente pigmentate e non richiedono l'aggiunta di un agente colorante.
I migliori campioni per la visualizzazione attraverso un microscopio ottico sono preparati da sottili fette di cipolle piccole e sode. L'orientamento delle cellule al microscopio ottico può aumentare o diminuire la loro visibilità. Maggiore è la quantità di luce che può passare, migliore è la risoluzione.
