Tre cose che possono denaturare gli enzimi sono la temperatura, il livello di pH e le concentrazioni di sale. Gli enzimi sono proteine; come con tutte le proteine, gli enzimi funzionano solo in determinati ambienti ottimali. Questi ambienti ottimali includono determinati intervalli di temperatura, livelli specifici di pH e particolari concentrazioni di sale.
Se un enzima non si trova nel suo ambiente ottimale, potrebbe non funzionare bene o addirittura non funzionare affatto. Gli enzimi diventano denaturati o sfigurati in ambienti non ottimali. Gli enzimi denaturati perdono le loro forme piegate tridimensionali naturali.
Molti enzimi non funzionano bene a temperature elevate. Un aumento della temperatura favorisce generalmente la funzione enzimatica, ma a temperature superiori ai 40 gradi Celsius, molti enzimi animali non funzionano più. Uno spostamento del livello di pH influenza i legami idrogeno, un tipo debole di legame che collega le parti dell'enzima tra loro; questo cambia la forma dell'enzima. I cambiamenti nella salinità influenzano il legame del gruppo R negli amminoacidi, i mattoni di tutte le proteine. Questi gruppi R, chiamati anche catene laterali di aminoacidi, interagiscono tra loro per produrre la forma tridimensionale di una proteina.
