Il miglior fertilizzante per peperoni è un mix bilanciato che contiene percentuali uguali di azoto, fosforo e potassio, come una miscela 10-10-10, suggerisce l'Associazione Nazionale dei Giardini. Una miscela che contiene troppo azoto inibisce la crescita dei peperoni.
Una dose di letame di pollo disidratato o di altri fertilizzanti organici a base animale beneficia anche i peperoni quando vengono aggiunti al terreno prima della semina.
Le piante di peperone che perdono i loro fiori prima che il frutto cresca mancano di magnesio. Aggiungendo magnesio durante la stagione della fioritura, i proprietari di piante possono aiutare a far germogliare un giardino di peperoni. Una soluzione semplice per uno spray al magnesio comporta la dissoluzione di 1 cucchiaio da tavola di sali di Epsom in una bottiglia spray di acqua, quindi spruzzare la soluzione sui fiori e sulle foglie della pianta.