L'aspettativa di vita di una persona con una deficienza immunitaria variabile comune si basa sulla frequenza e sulla gravità della malattia di un individuo, secondo la Home Reference della Genetica. Gli individui con il disturbo sono tipicamente adulti quando muoiono.
In uno studio di 40 anni su più di 400 pazienti con immunodeficienza variabile comune, l'età mediana maschile alla morte era di 42 anni, e l'età media femminile alla morte era di 44 anni, secondo la rivista Blood. I tassi di speranza di vita sono aumentati a causa di medici che usano più efficaci antibiotici e protocolli di trattamento. Lo studio ha dimostrato che la malattia polmonare è la principale causa di morte e il linfoma è la seconda causa più significativa di mortalità.