La differenza principale è che l'amido viene convertito dalle piante mentre il glicogeno viene convertito dagli animali. Tuttavia, sia l'amido sia il glicogeno sono polimeri polisaccaridici di glucosio alfa.
L'amido può essere sotto forma di amilosio, con centinaia di anelli di glucosio agganciati insieme da legami a-1,4 o amilopectina, che potrebbero contenere migliaia di anelli di glucosio agganciati insieme a una combinazione di a-1,4 e un -1,6 collegamenti.
Il glicogeno è il mezzo con cui gli animali immagazzinano il glucosio per un uso successivo. Ha entrambi i collegamenti a-1,4 e a-1,6, come l'amilopectina, consentendo molti rami molecolari e di conseguenza una maggiore area superficiale per una più rapida conversione di idrolisi al glucosio.