Sebbene sia la Striscia di Gaza che la Cisgiordania siano parte dei Territori palestinesi, hanno relazioni diverse con Israele. A partire dal 2015, il governo della Striscia di Gaza si oppone a Israele, mentre il governo della West Bank accetta la sua esistenza.
Sebbene gli Accordi di Oslo richiedessero che i Territori palestinesi venissero trattati come una sola unità, la separazione geografica dei due territori rese facile per i loro governi andare in direzioni diverse. Hamas, un'organizzazione radicale, è al potere nella Striscia di Gaza, a partire dal 2015. Hamas non riconosce Israele come un paese legittimo ed è in conflitto con il governo israeliano. A sua volta, Israele non riconosce Hamas come un governo legittimo. La Striscia di Gaza ospita un gran numero di rifugiati palestinesi e ai residenti è vietato recarsi nel resto del paese tranne che per motivi umanitari come le cure mediche.
Al contrario, Fatah, il partito responsabile in Cisgiordania, accetta l'esistenza di Israele e ha una relazione diplomatica con esso. La Cisgiordania è anche più laica della Striscia di Gaza, che segue una cultura islamica più severa. Grazie alle sue relazioni amichevoli con Israele, i residenti della West Bank hanno più libertà delle loro controparti a Gaza. La Cisgiordania ha anche un'economia migliore ed è meno dipendente dagli aiuti esteri di Gaza.
