La forza motrice del protone è l'energia generata dal trasferimento di protoni o elettroni attraverso una membrana cellulare trasducente l'energia. L'energia viene quindi utilizzata per eseguire lavori chimici, osmotici o meccanici.
La forza motrice del protone esiste negli eucarioti e nei procarioti. Negli eucarioti, si trova attraverso la membrana mitocondriale interna ed è generato dall'energia del ciclo dell'acido citrico. La forza motrice del protone viene utilizzata per produrre ATP da ATP sintasi. Nelle piante, la forza motrice del protone si trova nella membrana tilacoide dei cloroplasti. La forza è generata dalla reazione alla luce durante la fotosintesi. È usato per produrre ATP, che viene utilizzato nella fissazione della CO2.