Il fegato in un pesce serve per la digestione, la rimozione dei rifiuti e le funzioni di conservazione. Il fegato produce la bile, che aiuta nella digestione del cibo mentre procede attraverso lo stomaco e l'intestino. Questo organo serve anche come riserva di cibo, sostenendo il pesce quando le risorse alimentari sono scarse.
I fegati di pesce funzionano in modo analogo ai fegati di molti altri animali, inclusi gli umani. La bile è prodotta dal fegato per abbattere i grassi e le proteine, che consente al sistema digestivo di estrarre più nutrienti come processi alimentari attraverso il corpo. Il fegato viene anche utilizzato per rimuovere i rifiuti dal sangue e per aiutare a riciclare i vecchi globuli.
I fegati di molte specie ittiche sono ricchi di acidi grassi omega-3 e di vitamine A e D. A causa di questa caratteristica, i fegati di pesce e gli estratti di fegato di pesce, specialmente di merluzzo, sono utilizzati nella produzione di integratori alimentari che sono abitualmente consumato dagli umani.
I fegati di squali, pattini e raggi servono alla funzione aggiuntiva di fornire un mezzo per rimanere neutrali nell'oceano. Fegati di squalo contengono alti livelli di una sostanza chimica chiamata squalene, che funge da sostituto di una vescica natatoria o da nuoto che si trova nelle specie di pesci ossei.