Il pulsante sinistro è il pulsante principale del mouse e utilizzato per eseguire attività comuni come selezionare i comandi di menu, tirare giù i menu e fare doppio clic. Un doppio clic viene eseguito quando il pulsante sinistro del mouse viene premuto due volte in rapida successione, di solito circa mezzo secondo. Il doppio clic viene principalmente utilizzato per aprire le scorciatoie delle icone sul desktop e su altre finestre.
Premendo e tenendo premuto il tasto sinistro del mouse, gli utenti possono spostare oggetti sullo schermo o evidenziare il testo. Il trascinamento e il rilascio vengono principalmente utilizzati per spostare cartelle e file in posizioni diverse. La stessa azione viene applicata anche durante il ridimensionamento degli oggetti.
Il pulsante destro del mouse viene utilizzato principalmente per aprire i menu contestuali. La rotella di scorrimento è un tipo di pulsante del mouse diverso che include una rotellina, che può essere ruotata per fornire un input. Viene principalmente utilizzato per scorrere su e giù documenti lunghi. Se utilizzato insieme al tasto Ctrl, può ingrandire e ridurre.
Altre applicazioni come i videogiochi possono usare i pulsanti del mouse per altre funzioni, come sparare con un'arma in uno sparatutto in prima persona. Le impostazioni del mouse possono essere configurate per soddisfare le esigenze e le preferenze personali. Ad esempio, gli utenti mancini possono modificare il pulsante principale del mouse sul pulsante destro.