Tutti i resti fossili di Homo habilis provengono dal Kenya o dalla Tanzania nell'Africa nord-orientale. All'epoca, queste aree erano costituite da pianure erbose semi-aride intervallate da piccoli boschi. Archaelogyinfo.com nota che ci sono prove paleoecologiche che molti primi ominidi vivevano in boschi marginali, e questo si riflette nei resti di Homo habilis.
Le zampe del piede sono adatte per camminare eretti, ma le gambe mostrano evidenza di attaccamenti muscolari che avrebbero permesso all'Homo habilis di invertire i piedi in un modo che è buono per stabilire una presa forte con tutti gli arti durante la scalata. Camminare in posizione eretta era utile per vagare in pianure erbose alte e la possibilità di arrampicarsi sarebbe stata utile nei momenti in cui la specie viaggiava attraverso i boschi. Il fatto che la specie possa arrampicarsi non implica che fossero principalmente arboricoli. Alcune scimmie antropomorfe, anche oggi, nidificano negli alberi di notte, sebbene siano principalmente legate alla terra per abitudine. Ad esempio, i gorilla sono generalmente terrestri, ma le femmine e i giovani nidificano negli alberi di notte. Questo dà loro protezione dai predatori mentre dormono. Sebbene vi sia un dibattito sulle caratteristiche e persino sulla validità della specie, i fossili attribuiti all'Homo habilis non differiscono in modo marcato nell'habitat.