La pepsina è l'enzima che funziona meglio nell'ambiente acido dello stomaco, secondo Eyclopædia Britannica. Lo scopo principale dell'enzima è quello di scomporre le proteine alimentari in peptidi.
Eyclopædia Britannica spiega che la pepsina è immagazzinata nel rivestimento dello stomaco come pepsinogeno. Una volta rilasciato nello stomaco e miscelato con acido cloridrico, il pepsinogeno inattivo si scompone in pepsina attiva.
J. Stein Carter presso UC Clermont College osserva che la Pepsina ha bisogno di un livello di acidità tra pH 1.5 e pH 2.5 per funzionare efficacemente. Se l'acidità dello stomaco viene alterata attraverso l'uso di antiacidi, la capacità dell'enzima di digerire le proteine è drasticamente ostacolata.