La zona del crepuscolo, chiamata anche zona mesopelagica, ospita molte specie di calamari e polpi, così come alcuni pesci bioluminescenti, tra cui il pesce d'ascia. Alcuni animali simili a meduse chiamati ctenofori e sifonofori vivono anche nella zona.
La zona crepuscolare non ha vita vegetale perché l'oscurità dell'acqua impedisce la fotosintesi. Gli animali che vivono lì devono essere abbastanza forti da sopportare temperature più fredde e una pressione dell'acqua più pesante rispetto agli animali che vivono più vicino alla superficie. I pesci della zona crepuscolare, compresi il pesce vipera e il pesce drago, tendono ad avere corpi più pesanti perché, a differenza dei pesci di superficie, non hanno bisogno di nuotare velocemente. Spesso hanno grandi denti e bocche perché la loro preda potrebbe essere più grande di loro.
Alcuni animali viaggiano a volte in acque più basse. Questi includono pesci più grandi, come il pesce spada, i gatti pappagalli e le seppie. Nella zona mesopelagica si trovano anche diversi tipi di anguille, tra cui anguille e anguille. Alcuni erbivori possono talvolta avventurarsi nella zona mesopelagica, ma non rimanere lì a causa della mancanza di cibo. Gli animali che vivono lì per la maggior parte del tempo sono carnivori o animali che sopravvivono su materiali di scarto, come pellet fecali e organismi morti, che affondano nella zona del crepuscolo. Questi animali sono chiamati detritivori.