L'effetto principale della crisi di nullificazione era stabilire la supremazia del governo federale sui governi statali. Alla fine divenne anche un fattore nel causare agli stati del Sud di annullare l'Unione stessa, provocando la loro secessione e la creazione della Confederazione.
Thomas Jefferson e James Madison difesero per la prima volta la dottrina dell'annullamento nel tardo XVIII secolo. Jefferson propose che gli stati avessero il diritto di discernere se il governo federale avesse oltrepassato i suoi limiti e potesse negare qualsiasi legge ritenessero inappropriata all'interno delle loro stesse giurisdizioni. Mentre protestava contro la tariffa del 1828, il vicepresidente John C. Calhoun, originario della Carolina del Sud, sosteneva che gli stati avevano il diritto di veto sull'applicazione della legge federale. Quando una tariffa di compromesso del 1832 modificava solo leggermente la situazione, il legislatore della Carolina del Sud chiamò una convenzione di stato e adottò l'ordinanza di annullamento, che dichiarò entrambe le tariffe nulle per lo stato della Carolina del Sud.
Il presidente Andrew Jackson ha reagito in modo aggressivo. Il Congresso approvò la legge sulla forza, che gli permise di inviare i militari per raccogliere le tariffe. Hanno anche approvato un disegno di legge di compromesso, snaturando la legislazione della Carolina del Sud e inducendoli a ritirare l'ordinanza di annullamento. Tuttavia, i disordini negli stati meridionali continuarono, portando infine allo scoppio della guerra civile nel 1861.
