Durante la prima fase della dieta Atkins, l'induzione, un dieter può mangiare una quantità ragionevole di carne, pollame, pesce, uova e burro e oli vegetali. Dovrebbe limitarsi a 20 grammi di carboidrati netti da verdure come broccoli, fagiolini, sedano, asparagi e peperoni.
Durante l'induzione, un dieter non può mangiare cibi contenenti zucchero raffinato o farina, inclusi pane e pasta. Evita anche verdure amidacee, cereali, noci e semi, legumi come fagioli e piselli, caffeina e alcol. L'obiettivo durante questa fase è quello di spingere il corpo a bruciare i grassi invece dei carboidrati che normalmente utilizza per il carburante. Questa fase dura un minimo di due settimane.
La fase successiva è il bilanciamento. In questa fase, la dieta inizia ad aggiungere piccole quantità di alimenti ricchi di sostanze nutritive che contengono carboidrati come bacche, verdure, noci e semi. La gamma di cibi consumati continua ad aumentare durante la terza fase, la pre-manutenzione, che inizia quando il dieter è a 10 chili dal suo peso target. Durante la pre-manutenzione, il dieter può aggiungere fino a 10 grammi di carboidrati netti a settimana fino a quando non trova il punto in cui si ferma la perdita di peso. Se a quel punto è ancora a corto di peso, riduce i carboidrati fino a raggiungere il suo obiettivo. La fase finale è la manutenzione, che dura tutta la vita e mira a mangiare la quantità di carboidrati che consente al dieter di mantenere un peso sano.