Alcune delle principali forme di terra che si trovano in Honduras includono il vasto altopiano interno di colline e montagne, le pianure del Pacifico e le pianure dei Caraibi. Il clima varia da temperato nelle montagne a tropico nelle pianure. Un vasto sistema di fiumi attraversa le montagne della Sierra Madre, e le colline interne, e ampie e fertili vallate si trovano in questa regione.
Le pianure dei Caraibi sono circondate da spiagge sabbiose e si estendono lungo la costa settentrionale. Questa regione contiene la Costa delle Zanzare, un'area disabitata di giungla, lagune e mangrovie. Le pianure del Pacifico sono di dimensioni considerevolmente più piccole e circondano il Golfo di Fonesca in cui si trovano alcune isole vulcaniche dormienti. Questa zona di pianura diventa paludosa vicino alla costa. Nel complesso, l'Honduras è un paese ricco di acqua, con l'idroelettrico considerato una delle sue risorse naturali. C'è solo un lago significativo chiamato Lago Yojoa, ma ci sono molti fiumi importanti.
La regione montuosa interna ospita la maggior parte della popolazione dell'Honduras e rappresenta l'80% della sua superficie totale. Numerose vallate pianeggianti si trovano qui con villaggi, città e la capitale del paese, Tegucigalpa, situata su quelli più grandi. Il terreno in questa regione è per lo più difficile da attraversare e non adatto alla coltivazione a causa del terreno accidentato. Anche la qualità del suolo è scarsa. Una depressione comoda e prominente attraversa il paese attraverso la regione dell'altopiano e fornisce un percorso di trasporto relativamente facile tra le coste settentrionali e meridionali.