Gli archeobatteri sono microrganismi unicellulari che si trovano comunemente in luoghi altamente inospitali con forti sbalzi di temperatura o in acque con alti livelli di alcalino o acido. Il termine archaebacteria è stato ampiamente abbandonato per l'uso di archeologia , poiché sono la loro classe di organismi e non sono batteri.
Gli arcaebatteri furono scoperti negli anni '70 dal dott. Carl Woese, che stabilì che non potevano essere classificati come altri organismi unicellulari come eucarioti o eubatteri a causa delle loro differenze genetiche e biochimiche. Gli archebatteri hanno membrane cellulari altamente resistenti con zuccheri e amminoacidi che sono diversi da quelli che si trovano tipicamente nelle membrane cellulari dei batteri. Gli archebatteri sono in grado di sopportare influenze esterne che sarebbero fatali per i batteri, a causa della struttura chimica delle loro pareti cellulari. Sono molto abili nel sopravvivere in aree dove altri organismi non possono, ad esempio vicino a prese geotermiche sott'acqua, o in acque di alta salinità che altrimenti ucciderebbero o respingerebbero pesci e altri microrganismi.
Gli archeobatteri noti come metanogeni si trovano nei sistemi digestivi di diversi tipi di mammiferi, insetti e pesci e producono metano come parte del loro processo di produzione di energia. I termofili sono in grado di sopravvivere in habitat con alte temperature, mentre gli psicofili vivono in ambienti estremamente freddi. Gli alofili si trovano in ambienti con un alto contenuto di sale. Gli archeobatteri si trovano anche in ambienti più ospitali come le paludi, il suolo e le acque oceaniche.