I tratti che sono collegati agli alleli possono essere omozigoti o eterozigoti, secondo la Genetica Home Reference del National Institutes of Health. Questi sono anche noti come tratti recessivi e dominanti, rispettivamente.
Un tratto è omozigote o recessivo, se richiede la visualizzazione di entrambi gli alleli. Un tratto è eterozigote, o dominante, se richiede l'espressione di un solo allele da mostrare. Per esempio, il colore della pelliccia di agouti in porcellini d'india e criceti è dominante, ed è espresso come AA, mentre il colore della pelliccia nera è recessivo ed espresso come aa. Un individuo eredita un allele da ciascun genitore per ciascun gene.