I principali fiumi che scorrono in Germania sono il Reno, il Danubio e l'Elba. La maggior parte delle città tedesche sono state costruite sulle rive di questi fiumi. Altri fiumi degni di nota sono il Weser, Spree, Oder, Moselle, Main, Lech, Lahn, Isr, Havel e Ems.
Il Reno è il fiume più lungo in Germania e il 12 ° più lungo in Europa. Inizia nelle Alpi svizzere sudorientali e fa parte del confine franco-tedesco prima di attraversare la Germania e infine di svuotarsi nel Mare del Nord attraverso i Paesi Bassi. È lungo circa 820 miglia e ha diversi rami e affluenti lungo il suo percorso.
Il Danubio sorge dalla Foresta Nera nella città di Donaueschingen. Quindi scorre verso sud-est, passando attraverso quattro capitali nell'Europa centrale prima di confluire nel Mar Nero attraverso il delta del Danubio in Ucraina e Romania. Il fiume Danubio tocca o attraversa i confini di 10 paesi: Ungheria, Serbia, Austria, Germania, Bulgaria, Slovacchia, Romania, Croazia, Moldavia e Ucraina. Il suo bacino di drenaggio si estende in altri nove paesi.
L'Elba sorge nella catena montuosa dei Krkonose nella Repubblica Ceca settentrionale prima di attraversare la Boemia, poi la Germania e lo svuotamento nel Mare del Nord. I suoi principali affluenti includono i fiumi Ohre, Schwarze Elster, Mulde, Havel, Saale e Vltava. Il bacino del fiume Elba è il quarto più grande in Europa, ed è abitato da circa 24,5 milioni di persone.
