I crani degli scimpanzè presentano un piccolo volume craniale, musi pronunciati sporgenti dal davanti, grandi denti canini, naso piatto e mascelle diritte. I crani degli scimpanzé sono più piccoli di quelli umani. Le caratteristiche facciali sono diverse negli scimpanzè rispetto agli umani, così come le strutture che supportano il cervello e la capacità di vocalizzare.
Le fauci di uno scimpanzé contengono denti grandi e formano una forma a U. Le mascelle umane hanno un angolo arcuato per i denti, che supporta i muscoli più grandi per parlare. Il palato degli scimpanzé non è adatto per il discorso. Gli scimpanzé hanno 20 denti come giovani e 32 adulti maturi, che è simile agli umani.
Gli scimpanzé raggiungono i 5,5 metri di altezza come adulti, che supporta una capacità cranica di 1,75 tazze o 400 centimetri cubici. Il volume cranico umano è di 6 tazze, o 1.400 centimetri cubici. I crani più grandi, rispetto al volume corporeo, significano più tessuto nervoso e migliori capacità cognitive in varie parti del cervello. Il cervello di uno scimpanzé è situato più lontano dalla parte anteriore della faccia a causa di grandi creste sopracciglia.
Gli scimpanzé hanno naso piatto, guance piatte e piccoli menti. Queste caratteristiche sono più importanti per gli umani. Gli scimpanzé condividono il 99 percento del loro DNA con gli esseri umani, tuttavia queste due specie divergono tra 5 e 8 milioni di anni fa. Gli esseri umani sono diventati più alti e più pesanti, mentre gli scimpanzé sono rimasti più corti e leggeri.
