Gli indiani Cherokee hanno caratteristiche facciali simili a quelle degli altri indiani americani, che includono zigomi alti, occhi a mandorla, palpebre pesanti, grandi denti anteriori, orecchioni pesanti e pelle bronzea. Tuttavia, non tutti I cherokee possiedono queste caratteristiche fisiche, a causa dei primi contatti con i minatori scozzesi e tedeschi nel sud-est.
Alcuni Cherokee possono essere biondi, con gli occhi azzurri e la pelle chiara. Gli uomini Cherokee sono in genere tra 5 piedi e 4 pollici e 5 piedi e 5 pollici di altezza, con le donne che di solito sono meno di 6 pollici più corte. È interessante notare che i cherokee possono acquisire alcune delle loro caratteristiche fisiche dai popoli mediorientali, poiché il loro DNA ha delle somiglianze con quello di egiziani, turchi, libanesi, ebrei e mesopotamici.