La germinazione dei semi inizia quando la prima radice rompe il muro del seme e termina quando la prima coppia di foglie vere inizia il processo di fotosintesi. Le tre fasi intermedie sono quando la radice primaria, che viene chiamata radichetta, sviluppa i peli delle radici, i primi giovani germogli emergono dal terreno e la prima coppia di foglie vere si forma per iniziare a produrre cibo per la pianta.
La corretta germinazione dipende da diversi fattori che si verificano in armonia l'uno con l'altro. Il seme deve essere prima vitale o vivo e, nella maggior parte dei casi, deve aver subito un periodo di temperature rigide. Questo processo è chiamato stratificazione. Quando è presente la giusta combinazione di acqua e calore, il rivestimento del seme si rompe, permettendo alla radichetta di emergere. Questa radice iniziale serve anche ad ancorare la piantina al terreno in modo che piccole quantità di acqua e vento non rappresentino una minaccia per la sua sopravvivenza.
Dopo che la radichetta sviluppa piccoli peli radicali che iniziano a prendere nutrienti dal terreno, il primo germoglio, chiamato plumule, emerge dal terreno. La plumula conterrà due cotiledoni, che non sono vere foglie ma piuttosto materiale fotosintetico che si forma effettivamente durante il periodo embrionale. I cotiledoni sono più grandi delle foglie vere e servono a fotosintetizzare più energia possibile per la pianta in crescita. Quando i cotiledoni iniziano a diventare più piccoli e ingialliscono, le prime foglie vere cominciano ad emergere dalla plumula.
Subito dopo l'uscita delle vere foglie, i cotiledoni si accartocciano e cadono dalla pianta. La germinazione è completa quando le nuove foglie iniziano a fotosintetizzare l'energia dal sole per promuovere la crescita della pianta.