La deforestazione, la conversione della terra e il cambiamento climatico rappresentano i tre maggiori rischi per le foreste pluviali. Le foreste pluviali, come altri ecosistemi, richiedono condizioni specifiche per una salute ottimale. Affrontano la distruzione e il danno permanente da molte attività umane, principalmente guidate da incentivi economici, come il disboscamento e l'agricoltura commerciale.
Tra le minacce della foresta pluviale, la deforestazione pone molti problemi. La deforestazione comporta l'abbattimento di alberi e la rimozione di vaste aree di foresta pluviale per uso umano. Alcune persone raccolgono alberi nella foresta pluviale, li usano per la costruzione e creano beni di consumo a base di legno. La registrazione avviene legalmente e illegalmente; mentre il disboscamento sostenibile non rappresenta una minaccia per le foreste pluviali, il disboscamento illegale ha un costo. Secondo il World Wildlife Fund, le foreste pluviali del Borneo affrontano una perdita di terreno superiore al 55%. L'aumento della domanda globale di olio di palma, una sostanza presente in molti prodotti alimentari, alimenta il tasso di deforestazione. La perdita di terra lascia molte specie native senza casa e senza risorse di base, mettendo a repentaglio la loro sopravvivenza. Anche la necessità di pascoli e pascoli contribuisce alla deforestazione.
La conversione dei terreni, come trasformare le foreste in campi per la soia e le piante di palma da olio, aumenta il rischio di inondazioni e incendi nelle aree circostanti. Lo sradicamento e la rimozione degli alberi portano via le capacità di assorbimento d'acqua delle foreste e l'invasione umana nelle foreste porta a terre più asciutte e inclini agli incendi. Infine, i cambiamenti climatici, tra cui maggiori quantità di anidride carbonica nell'atmosfera e l'innalzamento del livello del mare, mettono a repentaglio la salute della foresta pluviale.
