L'invasione della Baia dei Porci ha imbarazzato gli Stati Uniti, ha spinto un cuneo tra il presidente Kennedy ei suoi servizi segreti e ha rafforzato le relazioni tra l'Unione Sovietica e Cuba. In seguito, gli Stati Uniti sono passati a metodi più segreti per cercare di deporre Fidel Castro, mentre i sovietici cominciarono a inviare rifornimenti e armi a Cuba per prevenire un'altra invasione. Questo alla fine ha portato alla crisi dei missili a Cuba nel 1962.
In termini di vittime, l'invasione della Baia dei Porci era essenzialmente un pareggio. Le forze cubane hanno subito 176 morti, almeno 500 feriti e circa 4.000 dispersi. La CIA e le forze espatriate hanno subito 118 morti, 360 feriti e 1.202 catturati. Diversi prigionieri presi da Cuba furono successivamente giustiziati. Alla fine, Cuba ha scambiato 1113 detenuti per circa 53 milioni di dollari in aiuti economici. Castro ha anche permesso a circa 1.000 parenti degli espatriati di lasciare Cuba per unirsi ai loro familiari negli Stati Uniti.
L'accumulo di forze missilistiche a Cuba dopo la Baia dei Porci ha scatenato una situazione di stallo tra gli Stati Uniti ei sovietici nell'ottobre del 1962. Gli Stati Uniti hanno scoperto missili nucleari balistici a raggio intermedio nella nazione insulare e ne hanno chiesto la rimozione. Dopo aver riscaldato la retorica diplomatica di entrambe le parti e il blocco navale di Cuba, i sovietici hanno accettato di rimuovere i missili in cambio dello smantellamento dei missili americani in Turchia e la promessa di non tentare mai più di invadere Cuba.
