North Dakota State University definisce una sonda di DNA come un piccolo pezzo di acido nucleico (tipicamente a singolo filamento di DNA) che viene utilizzato per rilevare gli strati complementari di DNA. Le sonde di DNA utilizzate negli esperimenti di ibridazione sono etichettate in modo che possano essere visualizzati.
Come spiega Wikipedia, le sonde del DNA sono tipicamente etichettate con basi radioattive o fluorescenti. È più comune utilizzare sonde di DNA fluorescenti perché è possibile scegliere una varietà di lunghezze d'onda fluorescenti diverse, che consente agli scienziati di ibridare più di una sonda su un dato campione alla volta.
Secondo "Human Molecular Genetics", le sonde di DNA possono essere utilizzate per una varietà di differenti tecniche di biologia molecolare. Se utilizzate con una macchia meridionale o settentrionale, le sonde del DNA possono essere utilizzate per rilevare frammenti di dimensioni di un gene o di un altro segmento di DNA in questione.
Le sonde del DNA possono anche essere utilizzate per tecniche di ibridazione in situ in fluorescenza, in cui i cromosomi sono denaturati su vetrini da microscopio. Questo metodo consente il rilevamento di aberrazioni cromosomiche più grandi, compresi cromosomi rotti o fusi. Le tecniche di pittura cromosomica utilizzano l'ibridazione in situ per colorare cromosomi in metafase di colori diversi, rendendo più semplice la mappatura dei cromosomi. Questa tecnica può anche essere utilizzata per rilevare sequenze cromosomiche che sono state conservate tra specie diverse.
