La speciazione peripatrica è un caso speciale di speciazione allopatrica in cui un gruppo relativamente piccolo di organismi viene isolato, di solito geograficamente, dalla popolazione principale. Un esempio di una condizione che incoraggia la speciazione peripatrica è la colonizzazione di nuove isole.
È probabile che la speciazione peripatrica si verifichi se un piccolo gruppo di organismi si trova escluso dal flusso genico con la specie madre. Le ridotte dimensioni della popolazione incoraggiano nuove mutazioni a risolverle molto rapidamente, il che consente una rapida diversificazione in un nuovo ambiente. Un esempio reale di questo è la radiazione delle iguane acquatiche nell'arcipelago delle Galapagos.