L'Era Paleozoica, che ha segnato l'apparizione di quasi tutti i phyla animali in pochi milioni di anni, è stata terminata da un'estinzione di massa. L'estinzione di massa era l'opposto virtuale di quello che era iniziato l'era, con oltre il 90 percento della vita mondiale viene spazzato via. Il recupero da questa estinzione di massa è durato quasi 30 milioni di anni.
Ci sono molte sottosezioni nell'Era Paleozoica, che si dividono in milioni di anni in pezzi più piccoli. La fine dell'era paleozoica è chiamata l'era di Permiano. Questa era ha visto numerosi cambiamenti climatici insieme alle fluttuazioni dei livelli di anidride carbonica e ossigeno. Ci sono numerose ipotesi su ciò che ha causato l'estinzione alla fine dell'era Permiana, tra cui l'idrogeno solforato, una grande meteora in Antartide o anche tutte le possibilità combinate in una sola.