La vita sul Mayflower è stata spiacevole e difficile, poiché il viaggio di 66 giorni era pieno di forti tempeste atlantiche e conflitti tra i passeggeri. Molti dei pellegrini protestanti hanno infastidito l'equipaggio e altri passeggeri provando a costringere la loro religione sugli altri, che ha portato alla lotta a bordo della nave. Il mal di mare, lo scorbuto e altre malattie del mare erano comuni.
I difficili mari dell'Atlantico nella seconda metà del viaggio di Mayflower hanno causato un particolare tributo all'equipaggio e ai passeggeri. Dal momento che coloro che si avventuravano sul ponte rischiavano di essere gettati fuori bordo durante il tempo inclemente, la maggior parte dei passeggeri rimaneva sottocoperta per la maggior parte del viaggio. Le famiglie creavano divisori di privacy negli spazi angusti, ma i soffitti bassi e le condizioni di oscurità e umidità hanno reso la situazione abitativa molto scomoda.
I pellegrini protestanti erano una minoranza sul Mayflower, che contava solo 41 dei 102 passeggeri. All'inizio del viaggio, i pellegrini tentarono di imporre le loro credenze religiose ai loro compagni di bordo, che vedevano con sospetto a causa della loro resistenza. Alla fine, i due gruppi si sono resi conto che la cooperazione era l'unico modo per sopravvivere al viaggio e prosperare nel nuovo mondo, e hanno firmato il Mayflower Compact per formare un'organizzazione civile. L'accordo divenne uno dei precursori del moderno dominio democratico e servì da modello per il successivo governo nelle Americhe.