Gli antibiotici curano l'infezione di un dente prendendo di mira e uccidendo i batteri specifici che hanno causato l'infezione. Spesso, questi sono usati in congiunzione con un trattamento fisico, come un trattamento canalare o drenaggio del pus, fermare l'infezione e ripristinare la salute al dente.
Gli antibiotici a base di clindamicina e penicillina sono più comunemente utilizzati per il trattamento di infezioni orali, tra cui amoxicillina. La penicillina e l'amoxicillina sono entrambi antibiotici beta-lattamici e uccidono alcuni tipi di batteri attaccando le pareti cellulari dei batteri e non permettendo loro di sintetizzare i componenti per creare nuove pareti cellulari. Senza le loro pareti cellulari, queste specie di batteri muoiono rapidamente. La clindamicina interferisce con alcune specie di capacità dei batteri di produrre nuove proteine, e questo impedisce loro di crescere. Il sistema immunitario umano uccide rapidamente i batteri rimasti.
Gli antibiotici insieme ad un altro trattamento, come un canale radicolare, sono molto efficaci nel chiarire l'infezione delle gengive e della mascella. Se gli antibiotici non vengono presi correttamente, tuttavia, l'infezione potrebbe tornare. Se gli antibiotici sono inefficaci, c'è il rischio che i batteri che causano l'infezione del dente possano diventare resistenti a quella classe di antibiotici in futuro. Se i batteri diventano resistenti agli antibiotici, allora la seguente infezione sarà molto più difficile da trattare.
