Krakatoa era uno stratovulcano e si formava espellendo la materia in modo tipico di altri stratovulcanoes. Secondo l'Oregon State University, gli stratovulcanoes sono a volte indicati come coni di cenere in riferimento al modo in cui sono costruiti.
Uno stratovulcano differisce da un vulcano a scudo in quello, mentre un vulcano a scudo è costituito dall'effusione di lava viscosa, i coni di cenere si formano dall'accrescimento delle ceneri e della cenere espulsi durante eventi più esplosivi. Questi detriti si accumulano fino a formare una montagna conica a pareti scoscese. Gli stratovulcano sono soggetti a detonazione esplosiva, come è successo a Krakatoa nel 1883, per esempio.