Mentre può essere difficile distinguere tra draghi barbuti maschi e femmine come cuccioli, i maschi adulti hanno una serie di fori visibili sul lato inferiore delle loro zampe posteriori e rigonfiamenti intorno all'ano. Cura deve essere preso quando si alza la coda per controllare i rigonfiamenti, poiché sollevarlo troppo lontano rischia di rompere la spina dorsale dell'animale. Anche i draghi barbuti maschi tendono ad essere più grandi delle femmine, con teste e barbe notevolmente più grandi.
C'è anche una differenza nel comportamento della testa tra i due sessi, che è più veloce nei maschi che nelle femmine. In genere, un drago barbuto maschio inizierà una rapida visualizzazione della testa e una femmina risponderà più lentamente.
Se si tiene un solo drago barbuto, il sesso è in gran parte irrilevante per i bisogni e il temperamento dell'animale, sebbene le femmine siano generalmente più docili dei maschi. Il sesso diventa più importante quando si tiene insieme più di un drago barbuto. Due o più draghi barbuti maschi, ad esempio, sono inclini all'aggressione e ai combattimenti. Mentre questo è raro tra le femmine, non è inaudito. Più comunemente, tuttavia, emergerà una relazione armoniosa e gerarchica tra due o più donne. Nel frattempo, se un maschio e una femmina sono tenuti insieme, produrranno uova.
